沼氣發電機組根據沼氣產量選擇合適的裝機容量，避免設備閑置或沼氣鋪張；1000KW左右的沼氣發電機組市場據有率高，性價比高，維護、維修、保養用度比較低。
多臺機組時，宜選用1000KW左右的統一規格，以降低運行用度和備件儲存。在臺數較少時，選擇一臺功率較小的。好比一臺1000KW加一臺500KW，便于在氣量變化較大時調節輸出功率，保證機組在70%以上的功率下輸出。
沼氣發電機組發電效率高意味著在消耗相同的燃氣時能發出更多的電。